查看文章

Karakterisasi molekuler dan morfologi pada klon kakao yang berasal dari Sulawesi Tenggara sangat penting dilakukan untuk mengetahui keunggulan dan hubungan kekerabatan dari masing-masing klon. Analisis keragaman genetik menggunakan marka molekuler juga bermanfaat untuk mendeteksi adanya duplikasi di antara klon yang dikoleksi. Tujuan penelitian adalah mengetahui keragaman genetik klon kakao lokal Sulawesi Tenggara berdasarkan marka SSR dan karakter morfologi. Penelitian dilaksanakan di Sub Station Penelitian Kakao, Desa Lebojaya, Kecamatan Konda, Kabupaten Konawe Selatan, Sulawesi Tenggara, dan Laboratorium Terpadu, Balai Penelitian Tanaman Industri dan Penyegar Sukabumi, serta Laboratorium Biologi Molekuler, Balai Besar Litbang Bioteknologi dan Sumber Daya Genetik Pertanian Bogor, mulai bulan April sampai November 2015. Analisis keragaman genetik dilakukan pada 21 klon kakao yang meliputi 19 klon lokal dan 2 varietas nasional sebagai pembanding dengan menggunakan 22 marka SSR. Hasil karakterisasi molekuler diperoleh 11 marka bersifat polimorfik, selanjutnya digunakan untuk mengelompokkan klon kakao menggunakan program NTSYS. Hasil pengelompokan membagi klon kakao menjadi 4 kelompok utama pada nilai kesamaan genetik 0, 46. Berdasarkan nilai jarak genetik > 0, 70 diperoleh 8 kombinasi klon kakao yang dapat dipilih sebagai tetua persilangan dengan harapan untuk meningkatkan efek heterosis pada keturunannya. Hasil karakterisasi morfologi secara umum menunjukkan adanya keragaman antar keempat kelompok kakao yang terbentuk. Berdasarkan …