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Florações de microalgas são fenômenos que, não obstante as possíveis causas naturais, são produzidas por ações antropogênicas. Na Lagoa de Araruama, florações ocorridas em 2005 e em anos subsequentes provocaram profunda mudança na comunidade fitoplanctônica1, desencadeando eventos de mortandade de toneladas de peixes associada à baixa dos teores de oxigênio dissolvido. Além deste, outro efeito nocivo associado às florações é a produção de toxinas tais como as ficotoxinas, produzidas por microalgas eucariotas, e as cianotoxinas, produzidas por cianobactérias. Amostras de peixes (tainha e savelha) e de seston2 apresentaram teores de microcistina pelo ensaio imunoenzimático (ELISA), e uma amostra de seston (São Pedro d’Aldeia em 22/08/07), em período não relacionado à mortandade de peixes, apresentou células que possuem genes que codificam a microcistina sintetase, enzima responsável pela síntese de microcistina. A sucessão de microalgas com concomitante presença de cianobactérias potencialmente tóxicas aponta para o risco de exposição crônica por parte da população que utiliza peixe como principal fonte de proteína.