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L'ADN total de communautés de 29 sols non contaminés et contaminés avec des hydrocarbures de pétrole et des organochlorés de l'Antarctique et du Brésil, ont été criblés pour la présence de neuf génes cataboliques, codant des monooxygénases d'alcanes ou des dioxygénases d'aromatiques, faisant partie de voies de biodégradation bactériennes connues. Des amorces et des sondes ciblant les génes de monooxygénases d'alcanes ont été dérivées de Pseudomonas putida ATCC 29347 (Pp alkB), Rhodococcus sp. souche Q15 (Rh alkB1, Rh alkB2) et Acinetobacter sp. ADP-1 (Ac alkM). De plus, les amorces et les sondes détectant les génes de dioxygénases d'aromatiques ont été dérivées de P. putida ATCC 17484 (ndoB), P. putida F1 (todC1), P. putida ATCC 33015 (xylE et cat23) et P. pseudoalcaligenes KF707 (bphA). Les amorces et les sondes ont été utilisées pour analyser les extraits totaux d'ADN des …