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Les éléments transposables (ETs) sont des éléments génétiques répétitifs et mobiles. Les ET autonomes contiennent toutes les séquences codantes nécessaires à leur excision, duplication et insertion. Les ET peuvent être considérés comme des éléments égoïstes ou des parasites génomiques, ayant le potentiel de dramatiquement perturber le génome par l’interruption de gènes, la délétion de séquences ou la modification de l'expression des gènes. Cependant, ces perturbations peuvent également offrir de nouvelles fonctions avantageuses. Des recherches récentes ont souligné les fonctions bénéfiques de certaines insertions d’ET, d’augmenter l'adaptabilité à de nouvelles conditions environnementales ou à des impacts toxiques, ou prenant part au protéome. Dans cette thèse, nous avons étudié comment les ET influencent les espèces fongiques, d'un impact local et à court terme à des échelles de temps …