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| 崇明三岛水质空间分布和季节变化 杨正东， 朱建荣， 黄菊 长江技术经济 4 (S1), 85-87, 2020 | | 2020 |
| 台风对舟山海域上升流和叶绿素分布的影响 杨伟， 黄菊， 于潭 厦门大学学报(自然科学版) 59 (S1), 24-31, 2020 | | 2020 |
| 南麂列岛养殖功能海域秋季潮致混合特征及其对营养盐浓度的影响 徐鹏， 黄菊， 蔡厚才， 陈万东， 章守宇 海洋与湖沼 49 (1), 17-23, 2018 | | 2018 |
| 2016 年冬末长江口及邻近海域海气 CO2 交换特征分析 程天宇， 高郭平， 胡登辉， 黄菊， 张春玲 海洋环境科学 37 (2), 264-273, 2018 | | 2018 |
| 2015年冬季南黄海水文特征及海-气CO2通量分析 黄菊， 高郭平， 程天宇， 胡登辉， 孙丹丹 上海海洋大学学报, 2017 | | 2017 |
