| Son Dönem Osmanlı Nüfusu ve Ecnebiler Meselesi S Gökçen Cedit Neşriyat, 2010 | 27* | 2010 |
| Bozdağ'ın işgali ve Ali Rıza Paşa hükümeti'nin istifası S Gökçen Atatürk Araştırma Merkezi, 2003 | 17 | 2003 |
| Milli Mücadele’de Yunan İşgallerinin Genel Karakteri S Gökçen Cumhuriyet Tarihi Araştırmaları Dergisi,(23), 89-112, 2016 | 13 | 2016 |
| ORTODOKS ÜÇGENİ - Yunanistan, Patrikhane ve Pontus salim gökçen IQ Kültür-Sanat Yayıncılık, 2014 | 12 | 2014 |
| ANKARA–MOSKOVA İLİŞKİLERİNİN GELİŞİMİ VE 1925 DOSTLUK VE SALDIRMAZLIK ANDLAŞMASI S Gökçen Uluslararası Karadeniz İncelemeleri Dergisi 3 (3), 117-140, 2007 | 11 | 2007 |
| Türkiye'de Rum-Yunan Vahşet ve Terörü S Gokcen IQ Kültür-Sanat Yayıncılık, 2010 | 10 | 2010 |
| FENER RUM PATRİKHANESİ'NİN HUKUKİ STATÜSÜ VE HEYBELİADA RUHBAN OKULU'NU AÇTIRMA GİRİŞİMLERİ S Gökçen Atatürk Dergisi 5 (1), 185-222, 2006 | 10 | 2006 |
| Türkiye-Yunanistan İlişkilerinde Temel Sorunlar S Gökçen Atatürk Dergisi 3 (2), 2002 | 10* | 2002 |
| İki darbe arası Türk demokrasisi (1961-1980) S Gökçen Atatürk Yolu Dergisi, 241-264, 2020 | 9 | 2020 |
| Atatürk Döneminde Türkiye-Yugoslavya İlişkileri ve Kral Alexandre'ın Türkiye Ziyareti S Gökçen Uluslararası Sosyal Araştırmalar Dergisi, 2016 | 8 | 2016 |
| Yunanistan'ın Batı Trakya Politikası: Batı Trakya Türklerinin Sorunları S Gökçen Atatürk Dergisi, 3 3, 2003 | 8 | 2003 |
| BALKANLARDA BÖLGESEL YAKLAŞIM: AVRUPA BİRLİĞİ'NİN BALKANLAR POLİTİKASI S Gökçen Atatürk Dergisi 5 (3), 115-132, 2010 | 7 | 2010 |
| Azerbaycan ile Türkiye Cumhuriyeti 9. ie 10. Sınıflar Tarih Ders Kitaplarında Yer Alan Osmanlı Tarihi Konularının Karşılaştırmalı Tarih Anlayışı Açısından İncelenmesi S Gökçen, M Aybar 21. Yüzyılda Eğitim ve Toplum 6 (17), 2017 | 5 | 2017 |
| Türkiye'de Rum-Yunan Tedhiş ve Terör Hareketleri (1919-1923) S Gökçen ATATÜRK ÜNİVERSİTESİ Atatürk İlkeleri ve İnkılâp Tarihi Enstitüsü, 2006 | 5 | 2006 |
| DOGMATİK YUNAN PARANOYASI" Anadolu'da Rum Soykırımı" S Gökçen Atatürk Üniversitesi Türkiyat Araştırmaları Enstitüsü Dergisi 12 (31), 73-92, 2006 | 5 | 2006 |
| Millî Mücadele Döneminde Yunanistan’ın Türkiye’deki Örgütlenme Faaliyetleri ve Rum Patrikhanesi S GÖKÇEN Yıl 14, 49-70, 2018 | 3 | 2018 |
| Atatürk ve Atatürkçü Düşünce Sorunsalı: Öğretmen Adaylarının Gözünden Yanılsamalar. S GÖKÇEN, ÖB ÖZTAŞKIN International Online Journal of Educational Sciences 9 (3), 2017 | 3 | 2017 |
| Fener-Rum Patrikhanesi'nin Günümüzdeki Faaliyetleri ve Pontus-Rum Soykırımı İddiaları S Gökçen Başlangıçtan Günümüze Pontus Sorunu, 2007 | 3 | 2007 |
| Bartholomeos, Ruhban Okulu ve Ekümenizm: Patrik’in Faaliyetlerinden Notlar S GÖKÇEN | 3 | 1985 |
| Lisans Düzeyinde Atatürk Algısı ve Farklılıklar S Gökçen, Ö Bektaş 21. Yüzyılda Eğitim ve Toplum 9 (27), 665-686, 2020 | 2 | 2020 |
