由于全球气候变暖及水体富营养化程度的加剧, 拟柱孢藻 (Cylindrospermopsis raciborskii) 逐渐由热带, 亚热带地区向温带地区扩散, 并在全球众多水体中占优势, 甚至形成水华. 拟柱孢藻的大量增殖不仅影响当地水生态系统的群落结构和物种多样性, 破坏水生态系统平衡, 其产生的有毒代谢物质还会在生物富集和食物链传递作用下, 最终对人类和其他动物造成威胁. 本文系统评估了拟柱孢藻的入侵和繁殖对当地水生态系统群落结构和物种多样性造成的潜在影响, 分析了拟柱孢藻入侵对水生生物多样性的影响机制. 拟柱孢藻入侵对水生态系统的影响不仅取决于拟柱孢藻自身特性及其入侵情况, 还与当地水生态系统的环境因子和物种组成有关. 因此, 不同地域和时间范围内, 拟柱孢藻入侵的生态后果有显着差异. 在一定的环境条件下, 拟柱孢藻主要通过种间竞争作用, 生态毒性作用及对水生细菌群落的调节作用等途径, 影响本地水生态系统的物种组成和生物多样性. 最后, 针对拟柱孢藻入侵的生态后果, 生物间相互作用及有效防控等热点问题进行了展望, 为全面认识拟柱孢藻入侵对水生态系统的影响提供理论依据.