開發從DNA 定序數據(NGS) 同時推測甲基化和基因體突變的機率模型

賀保羅 - 2019 - nckur.lib.ncku.edu.tw
次世代定序技術對生物學的進程有著革命性的影響. 過去十數年已有許多針對此技術開發的資料
分析方法, 但仍有發展空間. 全基因體DNA 甲基化定序是次世代定序研究中的重要主題之一 …

甲基化版顯式替代基因相似度評分程式可行性研究

張家銘 - 2020 - nckur.lib.ncku.edu.tw
DNA 甲基化是表觀基因組信息的一個題目, 在發育和癌症中起著核心作用. 最近,
亞硫酸氫鹽定序使推斷全基因組範圍內的DNA 甲基化成為可能. 但是, 這種推斷是通過讀取映射 …

DNA 甲基化相對機率的估計

蘇博彥 - 2015 - airitilibrary.com
摘要表觀基因組學正在對生物學產生了革命性的影響. 這學門的研究對於了解許多疾病的成因是
息息相關的. 本文將探討其中的一個機制, DNA methylation. 另外, 在生物醫療研究中 …

DNA 甲基化插補方法之比較研究

翁偉倫 - 國立臺灣大學流行病學與預防醫學研究所學位論文, 2021 - airitilibrary.com
DNA 甲基化是表觀遺傳學中十分重要的生物標記, 且已被許多研究證實DNA
甲基化與人體生物功能如老化, 癌症, 過敏及糖尿病等具有高相關性. 然而透過甲基化分析晶片 …

在亞硫酸鹽定序之基因序列資料中, 將EAGLE 之基因變異可能性評分方法延伸至胞嘧啶的甲基化程度評分

倪國勛 - 2021 - nckur.lib.ncku.edu.tw
DNA 甲基化是表觀遺傳學熱門的一個主題, DNA 的甲基化會降低該生物體基因區段轉錄作用(
Transcription) 之能力, 進而抑制相關蛋白質的生成, 被稱為基因靜默(Gene silencing) …

Efficient statistical methods for detecting differential methylation

V Halla-aho, H Lähdesmäki - International Conference on …, 2017 - research.aalto.fi
Addition of the methyl group to the 5-position of a cytosine (5mC) is the most commonly
studied epigenetic modification on DNA, and its effects on different diseases and cancer …

搜尋最適合亞硫酸氫鹽測序數據之基因組變異與胞嘧啶甲基化狀態的組合—基於EAGLE 變異點評估器程式碼庫之案例研究

張恆霖 - 2022 - nckur.lib.ncku.edu.tw
近幾年以來, 在基因表關遺傳學的研究領域當中, 很重要的一塊主題, 就是DNA 的甲基化現象.
DNA 甲基化是DNA 化學修飾的一種形式, 它能影響DNA 序列, 在不改變序列的情況下 …

LuxGLM: a probabilistic covariate model for quantification of DNA methylation modifications with complex experimental designs

T Äijö, X Yue, A Rao, H Lähdesmäki - Bioinformatics, 2016 - academic.oup.com
Abstract Motivation 5-methylcytosine (5mC) is a widely studied epigenetic modification of
DNA. The ten-eleven translocation (TET) dioxygenases oxidize 5mC into oxidized …

以降維分析DNA 甲基化與肺癌的關聯性

林晉昇 - 2020 - nckur.lib.ncku.edu.tw
肺癌是國人因癌症死亡最高的癌症, 好發於55 歲以上之族群. 就其生物特性及臨床表現分為小
細胞肺癌與非小細胞肺癌兩大類, 其中肺腺癌屬於後者, 目前已有接近七成的肺癌屬於肺腺癌 …

A Review on the techniques for characterizing and predicting human genomic DNA methylation

H Zheng, SW Jiang, H Wu - Current Bioinformatics, 2013 - ingentaconnect.com
Epigenetic modification refers to heritable changes in genotypes or phenotypes through
biochemical modifications without altering the underlying DNA sequence. In humans, DNA …