[HTML][HTML] 超临界水氛围下萘开环机理.
赵浩， 张英佳， 黄佐华 - Clean Coal Technology, 2023 - jjmjs.com.cn
… 原子存在连接关系的所有原子,并调用Open Babel程序库[26]将连接关系与各原子对应元素类型
进行识别,转换成SMILES字符串[27-28],同时利用Open Babel程序SSSR模块分析结构的环特性,…
进行识别,转换成SMILES字符串[27-28],同时利用Open Babel程序SSSR模块分析结构的环特性,…
[HTML][HTML] 基于众包的天然产物数据库及知识发现系统
郑乃仁， 邓玉林 - 轻工学报, 2016 - qgxb.zzuli.edu.cn
: 针对目前天然产物数据库数据更新不及时, 数据量不够大等问题, 开发了基于众包的天然产物
数据库及知识发现系统. 该系统利用众包技术构建一个天然产物数据库, 使用分子指纹对分子结构…
数据库及知识发现系统. 该系统利用众包技术构建一个天然产物数据库, 使用分子指纹对分子结构…
[PDF][PDF] 化学信息学与生物信息学开放性比较
乔园园， 鹿涛， 车云霞 - 化学进展, 2007 - manu56.magtech.com.cn
… MDL 公司规范和公开了多种分子结构,化学反应的标准 文件格式,可免费注册下载[ 14 ] ;Daylight
公司则在把 SMILES 的教程公布在网站上[ 15 ] ;针对格式转化的问 题已有开源的Open Babel …
公司则在把 SMILES 的教程公布在网站上[ 15 ] ;针对格式转化的问 题已有开源的Open Babel …
[HTML][HTML] 藏药二十五味珊瑚丸治疗阿尔茨海默病的网络药理学研究
胡贤达 - 2019 - html.rhhz.net
… 随后利用Open Babel 2.4.1软件, 将其转换成三维立体结构, 并输出后缀为.mol2的文件 [7] . …
Open Babel:an open chemical toolbox[J]. J Cheminform, 2011, 3: 33. doi:10.1186/1758-2946-3-…
Open Babel:an open chemical toolbox[J]. J Cheminform, 2011, 3: 33. doi:10.1186/1758-2946-3-…
[HTML][HTML] 基于分子对接技术对维生素D3 羟化酶底物谱的筛选及验证
杨儒洁， 朱文韬， 李遂焰 - Journal of Advances in Physical Chemistry, 2021 - hanspub.org
: 维生素D 3 羟化酶(Vdh) 是生物法合成维生素D 3 (VD 3) 活性形式25 (OH) VD 3 和1α, 25 (OH)
2 VD 3 的关键酶之一. 然而, 至今对Vdh 的天然底物了解甚少, 限制了其工业上的应用. 为了提高…
2 VD 3 的关键酶之一. 然而, 至今对Vdh 的天然底物了解甚少, 限制了其工业上的应用. 为了提高…
[HTML][HTML] 人工智能在基于配体和受体结构的药物筛选中的应用进展
刘润哲， 宋俊科， 刘艾林， 杜冠华 - 药学学报, 2021 - html.rhhz.net
… 在虚拟筛选的工作中, 可以使用Open Babel [41] 等软件, 将其他形式的分子格式转化为
SMILES的… Open Babel: an open chemical toolbox[J]. J Cheminform, 2011, 3: 33. DOI:10.1186/1758-…
SMILES的… Open Babel: an open chemical toolbox[J]. J Cheminform, 2011, 3: 33. DOI:10.1186/1758-…
基于分子对接和分子动力学模拟技术筛选SARS-CoV-2 3CL 蛋白酶抑制剂.
吉冰洁， 李尚， 王俭， 边远， 刘浩… - Journal of Shenyang …, 2023 - search.ebscohost.com
… 进行结构相似性搜索ꎬ下载 获得具有三维结构的数据集ꎬ共得到78 个小分子 化合物ꎮ 采用
OpenBabel 软件 … Open babel:an open chemical toolbox[J]. J Cheminformꎬ 2011ꎬ3:33. …
OpenBabel 软件 … Open babel:an open chemical toolbox[J]. J Cheminformꎬ 2011ꎬ3:33. …
烟草甲气味结合蛋白与驱避配体的分子对接.
常延斌， 王桂瑶， 奚家勤， 杨萌萌… - Journal of Nanjing …, 2023 - search.ebscohost.com
:[目的] 本文旨在利用分子对接技术研究烟草甲气味结合蛋白与驱避配体的分子对接ꎬ 以研发烟草
甲新型驱避剂ꎮ [方法] 利用AlphaFold2 软件预测11 个烟草甲气味结合蛋白(LserOBP) 的三维…
甲新型驱避剂ꎮ [方法] 利用AlphaFold2 软件预测11 个烟草甲气味结合蛋白(LserOBP) 的三维…
草地贪夜蛾鱼尼丁受体与双酰胺类杀虫剂的结合模式及抗性风险分析
李康， 王凯博， 陶丽红， 李丽， 李佳俊， 吴文伟， 肖春… - 农药学学报, 2021 - nyxxb.cn
… 配体构建从IRAC 查询双酰胺类杀虫 剂:氯虫苯甲酰胺,氟苯虫酰胺,溴氰虫酰胺, 环溴虫酰胺和四
唑虫酰胺的化学结构,使用Open Babel-2.4.1 软件获得化学结构的3D 结构,利用 Autodock Tool-…
唑虫酰胺的化学结构,使用Open Babel-2.4.1 软件获得化学结构的3D 结构,利用 Autodock Tool-…