[PDF][PDF] Phylogenetic relationships among species subgroups in the Drosophila saltans group (Diptera: Drosophilidae): Can morphology solve a molecular conflict

A Yassin - Zool Res, 2009 - researchgate.net
Abstract: Proper phylogenetic reconstruction is crucial for … phylogenetics, DNA signal still
may be limited by some intrinsic constraints such as codon usage bias. The phylogenetic

MrBayes 分子钟定年之程序

张驰 - 古脊椎动物学报, 2019 - vertpala.ac.cn
… The relaxed clock models account for evolutionary rate variation over time and among … such
variation in dating analyses. There are three relaxed clock models implemented in MrBayes: …

[HTML][HTML] 主流分子钟定年方法的原理, 误差来源和使用建议

陈旸康, 王益, 李家亮, 王文韬, 冯端宇… - 生物多样性, 2021 - biodiversity-science.net
近年来, 分子钟定年方法(molecular dating methods) 得以广泛运用, 为宏观进化研究尤其是生物
多样性及其格局形成历史的相关研究提供了不可或缺且十分详尽的进化时间框架. 贝叶斯方法(…

贝叶斯支端定年法推断分异时间和演化速率

张驰 - 古脊椎动物学报, 2021 - vertpala.ac.cn
… Key words Bayesian tip dating, fossilized birth-death process, relaxed clock, Mk model, …
Relaxed phylogenetics and dating with confidence. Plos Biol, 4: e88 Gavryushkina A, Zhang C, …

使用BEAST 2 开展贝叶斯支端定年分析

罗阿蓉, 张驰, 朱朝东 - Bio-protocol, 2021 - bio-protocol.org
… 常用的贝叶斯定年方法可以分为两类,一类是节点定年(node dating),另一类是支 端定年(tip
dating),… 对形态和分子数据分别 采用宽松钟模型,可具体设为Relaxed Clock Log Normal.该模型假设…

[PDF][PDF] 谱系年代研究进展

杨群, 丛培允, 孙晓燕, 马俊业, 盖永华, 李春香… - 古生物学报, 2009 - researchgate.net
… We present recent development in molecular dating techniques based on the relaxed
molecular clock concept and strategies in fossil calibration. Exam2 ples in recent development of …

[HTML][HTML] 鱼类遗传对喜马拉雅河流演化的记忆

李茜茜, 钱建硕, 黄俊豪, 朱仁, 林鹏程, 何德奎 - 第四纪研究, 2023 - dzkx.org
… Tentative divergence dates for main cladogenetic events were occurred since the mid-Pleistocene
Maximum Glaciation(Wangkun or Naynayxungla Glaciation). The phylogeographical …

[PDF][PDF] 基于DNA 条形码的物种界定算法比较研究——以北京周边地区舟蛾科为例

金倩, 武春生, 陈芬, 罗桂杰, 蔡卫佳, 刘旭, 杨采青… - 2017 - ir.ioz.ac.cn
[目的] 为了探究3 种常用物种界定方法(jMOTU, ABGD, GMYC) 的界定效果.[方法] 本研究以中国
北京周边地区10 个采样点483 个舟蛾科样品为例, 利用线粒体细胞色素C 氧化酶Ⅰ 亚基基因(…

蜚蠊目昆虫的野外采集, 标本制作和数据分析

邓文波, 车艳丽, 李志强, 王宗庆 - Bio-protocol, 2021 - bio-protocol.org
: 蜚蠊目昆虫系统学研究中, 基本可以分为两个方面: 经典分类学和分子系统学. 前者主要是通过
形态对蜚蠊目昆虫进行分类学研究, 后者则主要是从分子水平上来进行物种界定并研究各分类…

以演化时间为新增指标构建真菌分类系统.

赵瑞琳, 贺茂强, 刘建魁 - Mycosystema, 2021 - search.ebscohost.com
: 随着分子系统发育研究的普及, 真菌各分类类群逐渐被修订为单系发生类群, 通常结合形态学
特征为代表的表型特征(“单系+ 表型特征”) 对不同的分类等级命名是最为普遍的方法. 历史上存在…