Kepemimpinan dalam organisasi mutlak diperlukan. Kepemimpinan seorang yang mempunyai jiwa pemimpin memungkinkan arah dan tujuan organisasi berorientasi sesuai dengan visi dan misi. Kepemimpinan dalam varian pesantren terintegrasi tidak terkecuali. Ruh kepemimpinan dewasa ini dalam organisasi sosial dan lembaga pendidikan mengharapkan kepemimpinan yang dapat memberikan feedback atau dampak positif terhadap pola pengembangan organisasi khususnya lembaga pendidikan. Sebagaimana tercermin dalam varian pesantren terintegrasi yakni Pondok Pesantren Miftahul Ulum Kalisat Jember. Penelitian ini untuk mengungkap bagaimana perspektif kepemimpinan Qur’ani pada varian pesantren terintegrasi. Fokus penelitian menggunakan pisau analisis teori Cn. Cooley serta beberapa teori yang relevan. Jenis penelitian menggunakan studi kasus. Penggalian data melalui observasi, wawancara dan dokumentasi yang berikutnya dianalisis menggunakan langkah sebagaimana disampaikan Miles and Hubarman yakni kondensasi, kesimpulan dan verifikasi. Berdasarkan analisis ditemukan bahwa perspektif kepemimpinan Qur’ani pada varian pesantren terintegrasi mengimplementasikan nilainilai dalam Alquran dan Hadist. Nilai-nilai tersebut dikategorisasi dalam prinsip Amanah, Khidmah dan Barokah.