Electrostatic interactions in protein structure, folding, binding, and condensation

HX Zhou, X Pang - Chemical reviews, 2018 - ACS Publications
Charged and polar groups, through forming ion pairs, hydrogen bonds, and other less
specific electrostatic interactions, impart important properties to proteins. Modulation of the …

Conformational transitions in 3D model of bovine testicular hyaluronidase during molecular docking with glycosaminoglycan ligands

AV Maksimenko, RS Beabealashvili - Russian Journal of Bioorganic …, 2018 - Springer
In silico molecular docking of the trimer repeating unit of chondroitin sulfate (sulfated
hexasaccharide) and tetramer repeating unit of heparin (sulfated octasaccharide) to the 3D …

Конформационные переходы на 3D-модели бычьей тестикулярной гиалуронидазы при молекулярном докинге с гликозаминогликановыми лигандами

АВ Максименко, РШ Бибилашвили - Биоорганическая химия, 2018 - elibrary.ru
Выполнение методами вычислительной химии молекулярного докинга 3D-модели
бычьей тестикулярной гиалуронидазы in silico с тримером повторяющегося звена …

Domain analysis and site-directed mutagenesis of a thermophilic pullulanase from Thermotoga maritima MSB8

Y Zhao, Y Liu, Q Fu, Y Zhou, R Qin, H Xiong, Y Wang - 2023 - researchsquare.com
The structure of Thermotoga maritima MSB8 pullulanase (PulA) was modified for checking
the relationship of domain and site-directed mutagenesis with enzymatic properties. PulA …

Scrutiny of electrostatic-driven conformational ordering of polypeptide chains in DMSO: A study with a model oligopeptide

KR Srivastava, B Goyal, A Kumar, S Durani - RSC advances, 2017 - pubs.rsc.org
The physicochemical effects of the solvent DMSO on protein confirmation remain enigmatic
despite its diverse applications in the proteomics field. Many attempts to understand the …

Effect of the hyaluronidase microe nvironment on the enzyme structure–function relationship and computational study of the in silico molecular docking of chondroitin …

AV Maksimenko, RS Beabealashvili - Russian Chemical Bulletin, 2018 - Springer
The review addresses the biochemical interactions of hyaluronidases with components of
the natural microenvironment. The effect of subtle structural differences between ligands on …

Влияние гиалуронидазного микроокружения на соотношение структура-функция фермента и вычислительное исследование in silico молекулярного докинга …

АВ Максименко, РШ Бибилашвили - Известия Академии наук. Серия …, 2018 - elibrary.ru
В обзоре рассмотрены биохимические взаимодействия гиалуронидаз с компонентами
природного микроокружения. Отмечено влияние тонких структурных различий …

Electrostatic Interactions in Docking a 3D Model of Bovine Testicular Hyaluronidase with a Chondroitin Sulfate Trimer and a Heparin Tetramer

AV Maksimenko, RS Beabealashvili - Moscow University Chemistry …, 2018 - Springer
The molecular docking of a 3D-model of bovine testicular hyaluronidase with
glycosaminoglycan ligands is performed. A chondroitin sulfate trimer and a heparin tetramer …

Improved cytotoxicity of novel TRAIL variants produced as recombinant fusion proteins

M Figiel, P Bonarek, A Górecki… - Protein Engineering …, 2018 - academic.oup.com
Abstract The TNF-Related Apoptosis Inducing Ligand (TRAIL) cytokine triggers apoptosis
specifically in cancer cells. Susceptibility of a given cell to TRAIL depends on the activity of …

Электростатические взаимодействия в докинге 3D-модели бычьей тестикулярной гиалуронидазы с тримером хондроитинсульфата и тетрамером гепарина

АВ Максименко, РШ Бибилашвили - … университета. Серия 2 …, 2018 - cyberleninka.ru
Выполнен молекулярный докинг 3D-модели бычьей тестикулярной гиалуронидазы с
гликозаминогликановыми лигандами. В качестве последних использовали тример …