A novel method for the identification of conserved structural patterns in RNA: From small scale to high-throughput applications

M Pietrosanto, E Mattei, M Helmer-Citterich… - Nucleic acids …, 2016 - academic.oup.com
Functional RNA regions are often related to recurrent secondary structure patterns (or
motifs), which can exert their role in several different ways, particularly in dictating the …

A Taxonomy for RNA Motif Discovery

Z Mir, M Allahbakhsh, A Maghsoudi… - Computer and …, 2023 - cke.um.ac.ir
Motifs have critical impacts on the behavioral and structural characteristics of RNA
sequences. Understanding and predicting the functionalities and interactions of an RNA …

Parallel Polynomial-Time Approximation Scheme (PTAS) for Finding Compact Structural Motifs

B Brocka, S Yap, J Clemente - … of the 2023 10th International Conference …, 2023 - dl.acm.org
Structural motifs refer to patterns in 3D space that bear biological significance as they can
indicate regions in the protein that have important roles in biochemical functions. Finding …

IncMD: Incremental trie-based structural motif discovery algorithm

G Badr, I Al-Turaiki, M Turcotte… - Journal of bioinformatics …, 2014 - World Scientific
The discovery of common RNA secondary structure motifs is an important problem in
bioinformatics. The presence of such motifs is usually associated with key biological …

[PDF][PDF] یعیسو تلااصتا نینچمه، دراد یدایز تیمها دحاو ریز رد ار

PT Core, IV Helix - academia.edu
ی و محاسبات ی کی وانفورمات یب ی ها روش تا مهره داران با استفاده از اهان Page 1 هلجم یکشزپ تسيز
و تملاس کيتامروفنا یکشزپ کيتامروفنا تاقيقحت زکرم هرود موس هرامش مود . ص 131 - 118 ، 1395 …

[PDF][PDF] Non-Coding RNA Sequence Alignment by Molecular Sequence and Structure Properties

M Dan - 2019 - acgt.cs.tau.ac.il
Non-coding RNAs (ncRNA) play major roles in the cell through their sequence and structure.
Identifying functional units within RNA molecules is thus a key challenge. To identify different …

بررسی و مقایسه روند تکاملی زیر واحد TERT تلومراز از گیاهان تا مهره داران با استفاده از روشهای بیوانفورماتیکی و محاسباتی

نعیمی, مانوی, راهنورد, آپتین - مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی, 2016‎ - jhbmi.ir
مقدمه: تلومر پایانه فیزیکی کروموزوم های خطی می باشد که از یک توالی غیر کد کننده تشکیل
یافته و در حفاظت انتهای کروموزوم ها نقش دارد. بنابراین سیر تکاملی تلومراز، آنزیم سازنده …