Reconciliation of gene and species trees

LY Rusin, EV Lyubetskaya… - BioMed research …, 2014 - Wiley Online Library
The first part of the paper briefly overviews the problem of gene and species trees
reconciliation with the focus on defining and algorithmic construction of the evolutionary …

Rearrangement and inference of chromosome structures

KY Gorbunov, RA Gershgorin, VA Lyubetsky - Molecular Biology, 2015 - Springer
The chromosome structure is defined as a set of chromosomes that consist of genes
assigned to one of the DNA strands and represented in a circular or linear arrangement. A …

Ribosome reinitiation at leader peptides increases translation of bacterial proteins

SA Korolev, OA Zverkov, AV Seliverstov, VA Lyubetsky - Biology direct, 2016 - Springer
Short leader genes usually do not encode stable proteins, although their importance in
expression control of bacterial genomes is widely accepted. Such genes are often involved …

Перестройка и реконструкция хромосомных структур

КЮ Горбунов, РА Гершгорин, ВА Любецкий - Молекулярная биология, 2015 - elibrary.ru
Под хромосомной структурой понимают набор хромосом, состоящих из генов с
указанием их принадлежности одной из цепей ДНК, а также циклический или …

[PDF][PDF] О распараллеливании неоднородных циклов на суперкомпьютерах с распределённой памятью

ЛИ Рубанов - Информационные процессы, 2013 - jip.ru
Рассматривается задача построения типового алгоритма для параллельного
исполнения независимых итераций многократного цикла на мультипроцессорной …

Parallelization of nonuniform loops in supercomputers with distributed memory

LI Rubanov - Journal of Communications Technology and …, 2014 - Springer
A template algorithm for parallel execution of independent iterations of the repetitive loop on
a multiprocessor computer with distributed memory is constructed. Regardless of the …

Усредненная энтропия как характеристика консервативности участков генома

ОА Зверков, АВ Селиверстов… - Вестник российских …, 2013 - cyberleninka.ru
УДК 519.234.4 УСРЕДНЕННАЯ ЭНТРОПИЯ КАК ХАРАКТЕРИСТИКА
КОНСЕРВАТИВНОСТИ У Page 1 ISSN 1810-0198. Вестник ТГУ, т. 18, вып. 5, 2013 The …

Задачи и алгоритмы, связанные с хромосомными перестройками

ВА Любецкий, КЮ Горбунов - … информационные технологии и …, 2013 - cyberleninka.ru
В настоящее время накоплено значительное количество данных о геномах различных
организмов, в частности, об их хромосомных структурах. В связи с этим приобретает …

[PDF][PDF] Research Article Algorithms of Ancestral Gene Length Reconstruction

A Bolshoy, VM Kirzhner - academia.edu
Ancestral sequence reconstruction is a well-known problem in molecular evolution. he
problem presented in this study is inspired by sequence reconstruction, but instead of leaf …

Algorithms of ancestral gene length reconstruction

A Bolshoy, VM Kirzhner - BioMed Research International, 2013 - Wiley Online Library
Ancestral sequence reconstruction is a well‐known problem in molecular evolution. The
problem presented in this study is inspired by sequence reconstruction, but instead of leaf …