[PDF][PDF] 菠菜转录组SSR 位点分析及其分子标记的开发

潜宗伟, 陈海丽, 崔彦玲 - 农业生物技术学报, 2016 - journal05.magtech.org.cn
摘要简单重复序列(simple sequence repeat, SSR) 分子标记具有多态性高, 重复性好,
共显性等特点, 已广泛用于蔬菜作物遗传育种研究中. 本研究利用MISA 软件对菠菜(Spinacia …

Transcriptome analysis and development of simple sequence repeat (SSR) markers in Zingiber striolatum Diels

K Deng, R Deng, J Fan, E Chen - Physiology and Molecular Biology of …, 2018 - Springer
Illumina-based paired-end sequencing technology was used for the high-throughput
transcriptome sequencing of combined Zingiber striolatum Diels tissues (ie, root, stem, leaf …

Development of EST-SSR markers and their application in the genetic diversity of persimmon (Diospyros kaki Thunb.)

L Wang, H Li, Y Suo, W Han, S Diao, Y Mai, P Sun, J Fu - Trees, 2021 - Springer
Key message SSRs related to parent selection of D. kaki were validated by transcriptome
sequencing, and genetic diversity of these markers among 76 persimmon germplasm …

马铃薯转录组EST-SSR 挖掘及其多样性分析

巩檑, 巩檑, 程永芳, 甘晓燕, 陈虞超… - 《 分子植物育种》 …, 2015 - molplantbreed.org
摘要本研究以宁薯4 号叶, 根和匍匐茎茎尖为材料构建链特异性文库进行转录组测序并对测序
数据重新拼接. 应用SSR 检索软件从74.8 Mb 测序数据中(51 006 Unigenes) 发掘到1 867 …

基于简化基因组测序开发垂穗披碱草(Elymus nutans) SSR 标记

刘瑞娟, 路兴旺, 窦全文 - 2018 - ir.nwipb.ac.cn
摘要垂穗披碱草为青藏高原重要生态草及优质多年生牧草. 本研究中, 通过简化基因组测序技术
筛选和鉴定得到了14 个多态性的垂穗披碱草基因组SSR 标记. 14 个SSR 标记在24 …

水涝胁迫下辣椒转录组特征分析及EST-SSR 标记开发.

田怀志, 郭豪, 田浩, 熊兴伟, 张素勤, 耿广东 - Guihaia, 2023 - search.ebscohost.com
为开发适当的生物学工具以探索辣椒对水涝胁迫应答的分子机制ꎬ 该研究对不同淹水处理的
辣椒样本进行转录组分析ꎬ 获得了丰富的序列数据ꎬ 并在此基础上对SSR 分子标记进行挖掘ꎮ …

[PDF][PDF] 龙眼顶芽转录组简单重复序列(SSR) 标记信息分析及分子标记开发

郭栋梁, 王静, 韩冬梅, 潘学文… - … , WANG J, HAN DM, et al …, 2018 - plant-physiology.com
随着新一代测序技术的发展, 大量的转录组数据和表达序列标签(EST) 成为开发简单重复序列(
SSR) 标记的可利用资源. 本研究利用MISA 软件筛选龙眼(Dimocarpus longan) …

[PDF][PDF] 基于不结球白菜转录组EST-SSR 标记开发及多态性分析

杨丹青, 何晓丽, 杜志杰, 王树彬, 孙笠维… - 农业生物技术 …, 2019 - journal05.magtech.org.cn
摘要由转录组测序信息获得的EST-SSR 标记具有通用性好, 保守性高, 多态性丰富,
共显性遗传等优点, 广泛应用于植物种质资源的遗传多样性分析. 本研究通过对不结球白菜 …

基于高通量测序的出芽短梗霉转录组学研究

马赛箭, 马赛箭, 安超, 安超, 薛文娇, 薛文娇… - 计算分子生物 …, 2016 - biopublisher.cn
摘要为获得出芽短梗霉合成普鲁兰多糖的转录组信息, 揭示出芽短梗霉生长发育过程中转录组的
整体表达特征, 本研究采用Illumina HiSeq 2500 平台对出芽短梗霉swp 35 进行高通量测序 …

RNA sequence analysis of cassava varieties with high-starch content using De Novo assembly

YJ Guo, XL Luo, MG Wei, ZL Liu, WJ Fan… - Journal of Plant Growth …, 2018 - Springer
Abstract Cassava (Manihot esculenta Crantz) is an important raw material of cassava starch
and biological energy worldwide. Among the key traits for crop improvement, elite cassava …